新托马斯主义与永恒主义教育思想最为接近，西方有些学者干脆把新托马斯主义视为永恒主义的宗教派，或把永恒主义视为新托马斯主义的世俗派。不过，新托马斯主义与永恒主义亦有细微之别，其中最大的区别就表现在是否承认宗教意义上的上帝或神的存在，永恒主义将“形而上学”当作最高哲学，并止于形而上学，而新托马斯主义认为失去神学支持的形而上学是没有根基的，表现在教育上就是前者更倾向于注重对学生的思维的训练，希望通过心智的磨炼而获得真理，而后者则注重神启，强调宗教知识，注重宗教教育。不过，这种差别不是对抗和冲突性质的，因为永恒主义虽不提倡宗教教育，但对宗教抱着同情的态度。在永恒主义者的“百部名著”学习计划中，《圣经》也是必读作品之一。新托马斯主义对当代的各科学术的态度比永恒主义更积极、乐观些，对进步主义教育的活动课程也持谨慎的批评态度。除此之外，新托马斯主义与永恒主义在有关教育过程的一般目标、教学进程的性质、自由艺术的作用等重大教育问题上的观点基本一致，两者在反对进步主义教育和实用主义理论与实践中，在思想上最容易结成牢固的联盟。