三月初一，朱元璋自太平亲率水陆大军并进，三攻集庆。城外屯兵陈兆先战败投降，得兵三万六千人。集庆城破，守将福寿战死，水寨元帅康茂才和军民五十余万归降。朱元璋入城后，召集官吏军民大会，热切宣告：“元朝政治腐烂，到处起兵反对它，老百姓吃够了苦头。你们因处危城，成天担心害怕，生命没有保障。我带兵到这里是为你们除乱的。大家都要各安职业，不要疑惧；贤人君子愿意跟我建功立业的，以礼任用；做官的不许横暴，作践百姓；旧制度对百姓不好的立刻改掉。"一番话安定了人心，建立了正常的秩序。老百姓高兴极了，互相庆贺。当下改集庆路为应天府，设天兴建康翼统军大元帅府，以廖永安为统军元帅，以赵忠为兴国翼元帅守太平。儒士夏煜、孙炎、杨宪等十几人晋见，先后录用。小明王得到捷报后，升朱元璋为枢密院同佥，不久，又升为江南等处行中书省平章，李善长为左右司郎中，以下诸将都升元帅。
朱元璋得应天后，他的地盘以应天做中心，西起滁州，画一直线到芜湖。东起句容到溧阳。西边长，东线短，是一块不等边形，横摆着像个米斗，西线是斗底，东线是斗口。四面的形势是：东边元将定定扼守镇江；东南张士诚已据平江，破常州，转掠浙西；东北面青衣军张明鉴据扬州(今江苏江都);南面元将八思尔不花驻徽州(今安徽歙县),另一军驻宁国(今安徽宣城);西面池州(今安徽贵池)已为徐寿辉所据；东南外围则元将石抹宜孙守处州(今浙江丽水),石抹厚孙守婺州(今浙江金华),宋伯颜不花守衢州(今浙江衢县)。朱元璋局面小，兵力不强，处境四面受敌，虽然有了粮食，部队不致挨饿，军事形势却十分不利。