“三藩”各自把持驻地财源，鱼肉人民。吴三桂的王府原是南明永历皇帝所居五华山故宫，他在此基础上大肆兴建。吴三桂不仅占据沐氏全部庄田，又圈占明代卫所军田，将耕种这些土地的各族农民变为吴三桂的官佃户，恢复明末各种苛重的租税和徭役，此外还以放牧、狩猎等各种借口，强征人民土地，霸占其产业。
尚可喜、耿继茂早在顺治七年(1650)十一月便攻占广州。最初是两藩同驻一城，所以广州受害尤甚。他们创设“总店”,征收苛捐杂税。凡巧立名目不入正赋，或虽入正赋又加私抽的税目，均由“总店”征收。“总店”爪牙尽情搜刮，所得数额极为庞大，藩下所属私市私税,每年所获银两不下数百万，百姓是敢怒而不敢言。尚藩垄断对外贸易，不仅外商洋货全部控制，并乘朝廷厉行海禁之时，指使藩府参将沈上达大搞走私贸易。他们还侵夺民田，设立王庄、官庄，人民苦不堪言。
对于藩王之害，早已有人上奏朝廷。顺治十六年(1659)正月，曾任广东高要县的兵科给事中杨雍建，上疏反映了广东人民的苦难。然而，顺治皇帝为避免触怒藩王，并没有解决藩王问题，只是将耿藩撤走，改镇福建。